【液体活检干货分享】全式金磁珠法高效提取游离DNA
游离DNA是一种存在于动植物和人的体液中的细胞外游离状态的DNA，血中游离DNA又称循环核酸(circulating nucleic acid)，是指循环血中游离于细胞外的部分降解了的机体内源性DNA。1948年首次报道外周血中存在cfDNA，1994年从肿瘤患者外周血中检出RAS基因片段，cfDNA开始被人们重视。目前已经在血浆、血清、尿液、前列腺液、支气管灌洗液、唾液、脑脊液、胃液、胆汁、淋巴液、腹腔液及粪便中检测到了游离循环核酸。
在特定情况下(如肿瘤患者,孕妇,接受器官移植的患者等)，一小部分来自"异源性"细胞的cfDNA(如肿瘤细胞,胎儿细胞或供体细胞)可以作为基因检测的标志物。随着精准医疗时代技术的发展，越来越多的研究者和医生将基于cfDNA检测的"液态活检"技术应用于产前诊断，肿瘤的筛查，早期诊断，治疗监测和预后评估等多个方面，将其作为补充或替代组织活检的新方法。
高效的cfDNA的提取和检测对于下一步应用至关重要。游离DNA的检测技术有新一代测序（NGS）、数字PCR、ARMS-PCR、核酸质谱等。目前游离DNA分析的主要障碍之一在于无法有效获取血液中微量的cfDNA，收集操作困难，丢失量大，检验灵敏度低。目前，cfDNA主要的提取方法有硅胶柱法、酚-氯仿法和磁珠分离法等。
为克服传统提取方法的提取效率低，重复性差，抑制物残留多等缺点，全式金最新推出磁珠法cfDNA提取试剂盒（MagicPure® Cell-Free DNA Kit II 目录号EC211），该试剂盒操作简便，最大程度结合血浆cfDNA，去除杂质，使提取得到的血浆cfDNA中无大片度残留，且具有更高的纯度，尤其适合于小片段DNA的提取，在下游文库构建实验中具有更高的文库构建效率，更高的测序数据质量，更高的准确性。该试剂盒及提取方法已申请专利（专利名称一种提取血浆游离DNA的试剂盒和方法）。
提取效果展示
TransGen 提取的cfDNA 主片段浓度（Agilent 检测）均高于Company Q。
TransGen提取的cfDNA主片段大小小于Company Q，对90-150 bp的覆盖度要高于Company Q，有助于提高ctDNA的检出率，更好的应用于肿瘤研究。
文库构建分析
使用TransGen 和Company Q提取的cfDNA进行测序文库构建，在同样的PCR循环数下，TransGen提取的cfDNA进行后续文库扩增效率更高。
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